Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA3Q08378 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms