Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SPTBN1Q01082 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPTBN1Q01082 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms