Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVS71-1P61550 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms