Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms