Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTN2P35609 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms