Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC8A1P32418 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms