Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RTN3O95197 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTN3O95197 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTN3O95197 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTN3O95197 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTN3O95197 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTN3O95197 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTN3O95197 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTN3O95197 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RTN3O95197 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTN3O95197 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTN3O95197 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTN3O95197 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTN3O95197 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms