Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKAP2O75563 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms