Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOBPA7XYQ1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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