Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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