Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN3Q9P232 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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