Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms