Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCGF6Q9BYE7 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms