Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GTF3C6Q969F1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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GTF3C6Q969F1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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GTF3C6Q969F1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF3C6Q969F1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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