Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPD7Q5XG87 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms