Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
BRMS1LQ5PSV4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms