Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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NTRK2Q16620 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NTRK2Q16620 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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