Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms