Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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