Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IHHQ14623 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IHHQ14623 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IHHQ14623 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IHHQ14623 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IHHQ14623 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IHHQ14623 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IHHQ14623 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IHHQ14623 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IHHQ14623 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms