Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C1orf61Q13536 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms