Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 FAAP24-202ENST00000588258 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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MKRN4PQ13434 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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MKRN4PQ13434 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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MKRN4PQ13434 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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MKRN4PQ13434 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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MKRN4PQ13434 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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MKRN4PQ13434 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MKRN4PQ13434 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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