Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFRD2Q12894 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFRD2Q12894 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFRD2Q12894 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFRD2Q12894 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFRD2Q12894 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFRD2Q12894 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFRD2Q12894 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFRD2Q12894 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFRD2Q12894 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFRD2Q12894 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFRD2Q12894 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFRD2Q12894 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms