Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms