Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MC1RQ01726 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms