Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms