Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX1P83916 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX1P83916 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX1P83916 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX1P83916 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX1P83916 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX1P83916 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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