Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
RPL23P62829 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
RPL23P62829 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms