Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FNTAP49354 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTAP49354 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTAP49354 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms