Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CHRNA7P36544 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms