Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FGFR3P22607 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FGFR3P22607 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.7 ms