Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYT1P21579 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYT1P21579 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms