Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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