Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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HOXA2O43364 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HOXA2O43364 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA2O43364 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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