Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HHLA1C9JL84 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms