Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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