Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOBPA7XYQ1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOBPA7XYQ1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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