Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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