Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CTNNBIP1Q9NSA3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms