Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf85Q96MD7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms