Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
UBE2E2Q96LR5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms