Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms