Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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