Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms