Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC16Q8NEE8 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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TTC16Q8NEE8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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TTC16Q8NEE8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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TTC16Q8NEE8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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TTC16Q8NEE8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC16Q8NEE8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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