Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC84Q86UT8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms