Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC149Q6ZUS6 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms