Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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RTN1Q16799 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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RTN1Q16799 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RTN1Q16799 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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