Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFR3AQ14156 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms