Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC1Q13547 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HDAC1Q13547 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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